南京农业大学教授王凯与美国ＩＯＷＡＳＴＡＴＥＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ农村发展研究所博士方成合作在2001年中国国际棉花会议上的发言中认为，我国加入世贸组织后，将彻底打通棉花的进出口渠道，实行开放式的棉花进出口政策。
入世给我国棉花产业带来的影响具体可从进口和出口两方面来看：

一、加入ＷＴＯ对棉花进口的影响

2004年以前，我国对棉花的进口实行比例配额制，即对配额以内的进口棉花征收较低的关税（1％的关税），配额以外的进口棉花将不享受此项关税优惠（非配额部分以76％的进口关税征收，到2004年减至40％）。以优惠关税进口棉花配额数量在2000～2004年期间从74．3万吨增至89．4万吨。这一进口配额数量远远高于我国目前实际进口棉花的水平（1998年进口20万吨，1999年进口5万吨），这也意味着我国大大降低了棉花进口门槛，大量的进口棉将参与到国内棉花市场的竞争。从2005年开始将取消棉花进口比例配额制。

从棉花进口的主体看，进口棉花配额的33％被分配给国营贸易企业，67％被分配给非国营贸易企业。到2007年将允许外国企业从事全方位的流通服务，享受国民待遇。以上情况表明，入世后将打破国营贸易企业的进口垄断地位，形成多元的、多渠道的、平等的进口竞争关系。

二、加入世贸组织对棉花出口的影响

非歧视性原则是世贸组织的基本原则之一，包括最惠国待遇原则和国民待遇原则。我国入世后将有利于出口贸易根据非歧视性原则而获取最惠国待遇和国民待遇。加入世贸组织后对棉花出口的影响具体表现为：

发达国家间通过多边协议形式建立的纺织品和服装进口配额制（乌拉圭回合协议）到2004年后将对所有世贸组织成员国全部取消。当然，在此之前中国则需要与其主要出口市场通过双边谈判获取配额。

我国入世后将取消棉花等农产品的补贴。与美国、澳大利亚等棉花生产国相比，我国原棉生产成本高，比较效益低，在国际原棉市场中处于不利的竞争地位。因此，取消棉花出口补贴后将影响到国内的棉花出口。