长江流域复种指数较高，棉花多与其他作物套种，综合收益相对较高，加之2012年棉花气象灾害及病虫害情况较2011年减轻，大部分棉区棉花长势较好，交储比较顺利，籽棉交售价格高于黄河流域，棉农对价格接受度高，种植意向相对稳定。被调查棉农中，准备与上年持平的占55.7%，减少植棉面积的棉农占23.6%，准备增加的棉农占10.7%，徘徊户数占10%。全流域植棉意向下降3.7%，各主产省之间差别不大。减少的面积多为便于改为水田的田块，主要是由于国家对水稻等粮食作物的补贴逐年增加，棉花种植优势减小。
2012年新疆棉区的天气条件是近几年中最好的一年，棉花获得空前丰收，生育期总体提前，棉花采摘交售进展较快，避免了后期降温和雨雪的影响，大部分棉花进入国储，且单产大幅提高，棉农收益较好，2013年大部分棉农选择保持面积稳定，全疆植棉面积略有增长。被调查棉农中，与上年持平的最多，占88.2%，准备增加植棉面积的棉农不到1%，准备减少的棉农占6.9%，徘徊户数占4.1%。尽管增加户数不多，但每一户增加的面积较多，而减少户减少的面积较少，全流域按棉农报送的植棉面积计算，植棉意向增长2.8%。
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