用光学显微镜、透射电镜观察彩棉纤维,其形态结构与白棉相似,但胞腔大、次生胞壁薄,色素主要分布在纤维次生胞壁中。绿棉纤维次生胞壁中有同轴嗜锇层,白棉和棕棉则不存在;绿棉同轴嗜锇层与蜡质含量、色素有关。元素分析表明,其纤维素含量仅占85%～90%;绿棉其余物质成分主要为蜡质,含量约是白棉的6～13倍。彩棉灰分含量约是白棉的1.4～1.6倍，蛋白质含量约是白棉的1.75-2.1倍。等离子光谱分析表明，彩棉中大多数微量金属含量少于白棉，但铜离子和铁离子的含量高于白棉。
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